# /fs/sz-user-supported/Linux-i686/packages/fasta3/ssearch34 -f -7 -g -2 -s BLOSUM80 SSEARCH searches a sequence data bank version 3.4t25 Sept 2, 2005 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 gi|1322611|emb|CAA96791.1|, 749 aa vs bigtest-db.fa library opt E() < 20 0 0: 22 0 0: one = represents 1 library sequences 24 0 0: 26 0 0: 28 0 0: 30 0 0: 32 1 0:= 34 1 0:= 36 1 1:* 38 2 2:=* 40 0 2: * 42 3 3:==* 44 1 3:= * 46 1 3:= * 48 1 3:= * 50 7 3:==*==== 52 6 2:=*==== 54 1 2:=* 56 1 2:=* 58 0 1:* 60 1 1:* 62 0 1:* 64 0 1:* 66 0 1:* 68 0 0: 70 0 0: 72 0 0: 74 0 0: 76 0 0: 78 0 0: 80 0 0: 82 0 0: 84 0 0: 86 1 0:= 88 0 0: 90 0 0: 92 0 0: 94 1 0:= 96 1 0:= 98 1 0:= 100 0 0: 102 0 0: 104 0 0: 106 0 0: 108 0 0: 110 0 0: 112 0 0: 114 0 0: 116 0 0: 118 0 0: >120 0 0: 38540 residues in 31 sequences MLE_cen statistics: Lambda= 0.0040; K=1.912e-05 (cen=1) Kolmogorov-Smirnov statistic: 0.1734 (N=14) at 48 Smith-Waterman (PGopt) (5.0 Nov 2004) function [BLOSUM80 matrix (16:-8)], open/ext: -7/-2 The best scores are: s-w bits E(31) gi|50309611|ref|XP_454817.1| unnamed protein produ ( 648) 2249 28.8 0.032 gi|45198454|ref|NP_985483.1| AFL065Cp [Ashbya goss ( 659) 2150 28.2 0.049 gi|46396381|sp|Q874L7|MAD1_KLUDE Spindle assembly ( 674) 2093 27.9 0.063 gi|50289003|ref|XP_446931.1| unnamed protein produ ( 657) 1865 26.6 0.16 gi|68489062|ref|XP_711644.1| hypothetical protein ( 696) 1062 21.9 3.9 gi|50420311|ref|XP_458689.1| hypothetical protein ( 669) 868 20.7 7.7 gi|126276166|ref|XP_001387205.1| Spindle assembly ( 672) 827 20.5 8.9 gi|83770549|dbj|BAE60682.1| unnamed protein produc ( 743) 824 20.5 9.8 gi|121701263|ref|XP_001268896.1| M protein repeat ( 732) 812 20.4 10 gi|70995946|ref|XP_752728.1| conserved hypothetica ( 731) 798 20.3 11 gi|111068515|gb|EAT89635.1| hypothetical protein S ( 716) 789 20.3 11 gi|119495221|ref|XP_001264400.1| M protein repeat ( 732) 794 20.3 11 gi|119186713|ref|XP_001243963.1| spindle assembly ( 727) 777 20.2 11 gi|50554303|ref|XP_504560.1| hypothetical protein ( 704) 769 20.2 11 gi|134077296|emb|CAK45636.1| unnamed protein produ ( 719) 767 20.1 11 gi|115492055|ref|XP_001210655.1| conserved hypothe ( 732) 766 20.1 12 gi|67516829|ref|XP_658300.1| hypothetical protein ( 653) 737 20.0 12 gi|19112308|ref|NP_595516.1| hypothetical protein ( 689) 744 20.0 12 gi|85085420|ref|XP_957505.1| hypothetical protein ( 825) 753 20.1 13 gi|46120900|ref|XP_385120.1| hypothetical protein ( 761) 721 19.9 14 gi|39940664|ref|XP_359869.1| hypothetical protein ( 782) 665 19.6 17 gi|116195184|ref|XP_001223404.1| hypothetical prot ( 809) 625 19.3 19 gi|66803542|ref|XP_635612.1| hypothetical protein (1492) 711 19.8 22 gi|121917034|gb|EAY21811.1| viral A-type inclusion (1553) 708 19.8 22 gi|123412552|ref|XP_001304086.1| hypothetical prot (1684) 699 19.8 24 gi|123419083|ref|XP_001305473.1| hypothetical prot (1467) 657 19.5 24 gi|123462989|ref|XP_001316891.1| viral A-type incl (2832) 733 19.9 27 gi|123409642|ref|XP_001303475.1| Formin Homology 2 (2354) 650 19.5 28 gi|121915630|gb|EAY20417.1| viral A-type inclusion (4263) 726 19.9 30 gi|123469906|ref|XP_001318162.1| viral A-type incl (5296) 699 19.8 31 gi|124506427|ref|XP_001351811.1| hypothetical prot (1869) 420 18.1 31 >>gi|50309611|ref|XP_454817.1| unnamed protein product [ (648 aa) s-w opt: 2249 Z-score: 99.0 bits: 28.8 E(): 0.032 Smith-Waterman score: 2249; 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